To, że system ten został wprowadzony centralnie przez Ministerstwo Finansów, jest bez znaczenia - stwierdził Naczelny Sąd Administracyjny. Bezpieczeństwo danych w Poltaksie zakwestionował generalny inspektor ochrony danych osobowych. W trakcie kontroli w urzędach skarbowych w 2003 r. inspektorzy GIODO wykryli, że nie umożliwia on odnotowywania, komu, kiedy i w jakim zakresie udostępnia się dane podatników.