Doradca podatkowy to zawód zaufania publicznego, tak jak adwokat czy radca prawny. Jego pozycja jest jednak słabsza niż przedstawicieli tych dwóch profesji. Dotyczy to zwłaszcza postępowania sądowego.
Z przepisów wynika bowiem wprost, że doradca jest uprawniony do występowania wyłącznie w sprawach dotyczących obowiązków podatkowych. Nie może być więc pełnomocnikiem w sprawach celnych, mimo że decyzje dotyczące cła zapadają w trybie postępowania podatkowego. Potwierdza to orzecznictwo sądów administracyjnych. Takie rozwiązanie jest jednocześnie ostro krytykowane przez doktrynę.