Ciągle istnieją wątpliwości, czy obowiązuje odrębna, bezlimitowa ulga obejmująca darowizny na kościelną działalność charytatywno-opiekuńczą. Kwestię tę ma rozstrzygnąć skład siedmiu sędziów Izby Finansowej Naczelnego Sądu Administracyjnego.
O skierowaniu pytania prawnego w tej kwestii do Izby Finansowej zadecydował zwykły skład NSA, do którego trafiła sprawa małżonków W. W latach 1997 i 1998 darowali oni na kościelną działalność charytatywno-opiekuńczą 85 tys. zł i o te kwoty pomniejszyli swe dochody. Przyjęli, że podstawą odliczenia jest art. 55 ustawy o stosunku państwa do Kościoła katolickiego, pozwalający na pomniejszenie dochodu o całą darowiznę. Podobne przepisy o ulgach podatkowych znajdują się we wszystkich 12 ustawach o stosunku państwa do poszczególnych Kościołów i związków wyznaniowych.